Υπάρχουν εμβόλια που συστήνονται να γίνονται και εμβόλια που δεν πρέπει να γίνονται στην έγκυο.
• Δεν πρέπει να γίνεται κανένα εμβόλιο που περιέχει ζώντες εξασθενημένους ιούς στην έγκυο . Επίσης θα πρέπει να αποφεύγεται εγκυμοσύνη για ένα μήνα μετά από εμβόλια με ζώντες εξασθενημένους ιούς. Αυτά είναι της ανεμοβλογιάς, ιλαράς παρωτίτιδας, ερυθράς, κίτρινου πυρετού, αντιφυματικό.
• Από τα υπόλοιπα εμβόλια που περιέχουν ατοξικά προιόντα μικροοργανισμών ,δύο είναι αυτά που συστήνονται να γίνονται στην εγκυμοσύνη:
-Εμβόλιο κατά διφθερίτιδας-τετάνου-κοκκυτου μεταξύ 24 και 32 εβδομάδας κύησης. Τονίζεται πλέον σε όλα τα συνέδρια ότι αυτός είναι ο τρόπος να προφυλάξουμε τα νεογνά και μικρά βρέφη από τον κοκκύτη. Ο λόγος είναι ότι κατά το τρίτο τρίμηνο της κύησης, περνούν μέσω του πλακούντα τα προστατευτικά αντισώματα της μητέρας στο έμβρυο, και το προστατεύουν από το να νοσήσει από κοκκύτη στο πρώτο δίμηνο της ζωής του, μέχρι να κάνει το πρώτο του εμβόλιο. Ν α θυμίσουμε ότι ο κοκκύτης είναι νόσημα που υπάρχει ακόμα, δεν είναι σπάνια οντότητα και μπορεί να προσβάλει το νεογνό αν αυτό εκτεθεί μετά τη γέννηση του σε κοκκύτη, αφού σε πολλές περιπτώσεις αυτός που έχει κοκκύτη μένει αδιάγνωστος γιατί το μόνο του ενόχλημα μπορεί να είναι ο βήχας. Το νεογνό όμως κινδυνεύει μεταξύ άλλων από κρίσεις άπνοιας και προσφάτως είχαμε στην επικαιρότητα νεογνά που νοσηλεύθηκαν σε μονάδα λόγω κοκκύτη.
-Αντιγριππικό εμβόλιο. Συστήνεται από το ΚΕΕΛΠΝΟ να γίνεται στις ομάδες υψηλού κινδύνου στις οποίες ανήκουν οι έγκυες, τον Νοέμβριο και τον Φεβρουάριο.