Η καλύτερη αντιμετώπιση του προβλήματος της αλλεργίας σε μύκητες είναι η πρόληψη με αποφυγή της επαφής με τους σπόρους των μυκήτων.
Η καταπολέμηση των μυκήτων στα σπίτια και σε άλλα κτίρια είναι όχι μόνο για το καλό των ασθενών αλλά και για όλους τους άλλους. Το πλύσιμο με διάλυμα χλωρίνης ενός τοίχου με μούχλα, σκοτώνει γρήγορα τους μύκητες που τη δημιουργούν.
Υπάρχουν επίσης στο εμπόριο προϊόντα ειδικά για την αντιμετώπιση των μυκήτων.Ο καλός αερισμός και η τακτική καθαριότητα με χρήση αντιμυκητιασικών προϊόντων των χώρων που προσβάλλονται εύκολα από μύκητες, η μείωση του ποσοστού υγρασίας όταν αυτή είναι υπερβολική (πέραν του 50%) με τη χρήση συστημάτων εξαερισμού των χώρων ή άνοιγμα παραθύρων, η εξάλειψη συλλογής υγρών ή νερού σε ρωγμές ή αλλού, συγκαταλέγονται στα μέτρα καταπολέμησης της μούχλας.Επίσης είναι καλύτερο να αποφεύγονται τα χαλιά σε υπόγεια ή στα μπάνια. Εάν οποιαδήποτε ταπετσαρία στο σπίτι ή αλλού, σε έπιπλα ή άλλα αντικείμενα μουσκευτεί, τότε είναι αναγκαίο να στεγνώνεται άμεσα ή να εξετάζεται ανάλογα με την περίπτωση η δυνατότητα αντικατάστασης της. Το ίδιο ισχύει και για τα χαλιά.
